被辞退工资结清仍可申请仲裁。依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，若劳动者与用人单位存在劳动争议且未超时效，即可申请劳动仲裁，处理劳动报酬等争议。未及时申请可能导致权益受损，影响劳动仲裁结果。
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被辞退后申请仲裁的常见方式有协商、调解与仲裁。首先可与用人单位协商，协商不成可申请调解；调解不成或不愿调解，可直接提起劳动仲裁。选择处理方式时，应考虑效率与效果，优先选择能快速解决争议的方式。
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被辞退后仲裁前，应做以下处理：1. 收集证据，包括合同、工资单等；2. 与用人单位沟通协商；3. 申请调解或直接提起劳动仲裁。若协商与调解均无果，则根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》准备相关材料，正式提起仲裁。