商铺40年使用权到期可申请续期。依据《中华人民共和国城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》，期满前需向国土部门申请续期并补交出让金，否则国家将无偿收回土地使用权及房屋。不及时处理可能导致失去商铺所有权。
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商铺土地使用权到期常见处理方式是申请续期。若选择续期，需提前向国土部门提交申请并缴纳相应费用；若不续期，则面临土地使用权被收回的风险，需提前做好资产处置准备。
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商铺到期可续期。操作如下：1. 到期前一年向国土部门提交续期申请；2. 按规定补交土地出让金；3. 获得批准后继续使用商铺。若不续期，需准备资产处置，避免损失。